PathVisio

PathVisio е с отворен код и напълно безплатно приложение с графичен реализира в езика Java програмиране и проектиран от земята да се използва за показване, анализ и редактиране на биологични пътеки под операционна GNU / Linux system.Can да се използва за изготвяне пътеки , свържете биологична entitiesThe софтуер позволява на потребителите да се направи пътища, свържете биологични единици (протеини или гени) за биологични данни, с помощта на идентификатори на бази данни, редактиране на пътеки, както и да се анализират пътеки. С PathVisio вие също ще бъде в състояние да картографира експериментални данни, като данни за микрочипове, и тя се визуализира в горната част на съществуващия път чертежа.
В допълнение, ще можете да изберете база данни ген, изберете метаболитен база данни, да видите статистиката, експресивни внос на данни, изберете израз за масиви от данни, пътеки Търсене, преглед легенда, манипулират обекти, проекти за внос, както и за инсталиране и управление на плъгини, които могат да добавят допълнителна функционалност на app.Requires няма приложение installationThe могат да се използват, без да го инсталирате на вашата операционна система GNU / Linux. Всичко, което трябва да направите, е да изтеглите двоичен пакет от Softoware, запазването на архива на място по ваш избор, го изрежете с полезност архив мениджър, отворете извлечената директория, и кликнете два пъти върху pathvisio.jar file.Under на hoodWhile като един бърз поглед под капака на софтуера PathVisio, ние & rsquo; Забелязахме, че заявлението е написана изцяло на езика Java програмиране, както и че неговата графичен потребителски интерфейс е проектиран с най-новите технологии Java Swing. Ние & rsquo; Успешно тествани прилагането на компютри, поддържащи или на 32 или 64-битов процесор architectures.Runs на на всяка OS където Java е supportedBeing написани на езика Java програмиране, PathVisio може да бъде обявен за платформено-независим приложение, което поддържа GNU / Linux , Microsoft Windows, Mac OS X, BSD, Solaris, както и всяка друга операционна система, където се поддържат най-новите технологии Java

Какво ново в тази версия:.

• 31 яну, 2014: Bug освобождаване Fix
• GeneOntology отношение сега се отстраняват от резултата от търсене за анотации
• DataNodes трябва да бъде заверен с ID и Datasource или нищо (спестяване възли данни само с лична карта или източник на данни не се допуска повече)

Какво ново във версия 3.1.2:

• Major бъг в модул файл внос, определено: HTTP: //developers.pathvisio.org/ticket/1697

Какво ново във версия 2.0.11:

• Autosave
• Zoom, използвайки скрол
• Избор на линии е по-лесно: вече не е необходимо да кликнете върху точното пиксел
• Сега с два метода за свръхпредставителството анализ; един път ориентирани данни и един ориентиран

Какво ново във версия 2.0.10:

• New начин на рисуване заоблени правоъгълници за да се избегне разтягането ефект
• Различни малки поправки на грешки

Какво ново във версия 2.0.9:

• New тип конектор за съединител за произволна дължина и произволно ъгли
• New & quot; клетъчен компонент & quot; имот за съхраняване на биологичното смисъла на дадено отделение
• New & quot; двойна & quot; Тип на линия (особено полезно за двойни-membraned органели)
• може да се кликва хипервръзки в пътеки
• виж събитие: & quot; milestone_27 & quot; За пълен списък на бъгове поправки

Какво ново във версия 2.0.8:

• Подобрени форми за клетъчни компоненти
• Няколко използваемост подобрения, като например копиране / поставяне в появилото се меню
• виж събитие: & quot; milestone_26 & quot; За пълен списък на бъгове поправки

<силни> Какво ново във версия 2.0.7:

• лентата с инструменти икони и нови странични панела, за да направи по-лесно за да изберете вида стрелки и форми (благодарение liubing)
• пътека бази данни, се включват като източник на данни, така че можете да добавите връзки от една пътека в друга
• BioPAX конвертор е подобрена и произвежда повече валидни BioPAX документи.
• нов тип конектор, където могат да бъдат манипулирани отделните точки (благодарение leonth)
• Брой на източници на данни е увеличен на над 180
• виж събитие: & quot; milestone_25 & quot; За пълен списък на бъгове поправки

Какво ново във версия 2.0.6:

• Броят на котви по форма може да се увеличи от неизпълнението 12.
• Легенда за визуализация на данни, вече могат да бъдат показани на самото изображение на път. Преди се е видим само в страничен панел.
• виж събитие: & quot; milestone_24 & quot; За пълен списък на бъгове поправки

Какво ново във версия 2.0.4:

• подобрено форматиране на текст от форми, етикети и datanodes
• много повече форми за datanodes
• Обикновено пикселни координати
• зададете цвят на фона на datanodes

Какво ново във версия 2.0.3:

• Най-забележително в това издание е новият XML Schema за формат на път GPML (версия 2010a). Този нов път формат ще позволи на много нови и графични възможности в бъдеще, можете да очакваме с нетърпение да се някои от тези, дадени в следващата версия.
• Други нови функции:
• Невидими котви са наистина невидими, най-малко, когато нещо е, свързани с тях (Благодарение на Margot)
• допълнителна опция -v команден ред (благодарение на Mark)
• Избран база данни се показва правилно в лентата на състоянието отново
• Много ново разширение точки за плъгин разработчици
• виж събитие: & quot; milestone_21 & quot; За пълен списък на бъгове поправки

Какво ново във версия 2.0.1:

• Подобрен алгоритъм за автоматични съединители, които водят към котва .
• Подобряване на чертеж на видове със стрелки, които имат кратък & quot; пропаст & quot; в края.
• защото трудовият стаж на Thawte Freemail е бил отменен, ние се обновява на нашия свидетелство за сигурност
• Зрителят Пътека История имаше бъг, при който се счита за всяка линия модифицирани, дори и да не е. Това е фиксиран.

<силни> Изисквания :

• Oracle Java Standard Edition Runtime Environment