Swiss-PdbViewer (известен още като DeepView) е приложение, което предоставя удобен потребителски интерфейс позволява да се анализират няколко протеини в същото време. Протеините могат да се наслагват един върху друг, за да се направи извод структурни изравнявания и сравни техните активни обекти или други съответни части. Аминокиселинни мутации, Н-връзки, ъгли и разстояния между атомите са лесно да се получи благодарение на интуитивния графичен и меню интерфейс.
Swiss-PdbViewer (известен още като DeepView) е разработен от 1994 г. от Никола Guex. Swiss-PdbViewer е тясно свързана с SWISS-MODEL, автоматизирана хомология моделиране сървър, разработен в рамките на Швейцарския институт по биоинформатика (SIB) по биоинформатика Групата Структурно в Biozentrum в Базел.
Работа с тези две програми значително намалява обема на работата, необходима за генериране на модели, тъй като е възможно да вденете първична последователност протеин върху 3D шаблон и да получите незабавна обратна връзка за това колко добре ще е с резба протеин приетите от съответната структура, преди подаването на искането за изграждане на липсващите линии и усъвършенства странична верига опаковане.
Swiss-PdbViewer да прочетете и карти на електронната плътност, и предоставя различни средства за изграждане на плътността. В допълнение, различни инструменти за моделиране са интегрирани и командни файлове за популярните пакети за минимизиране на енергия могат да бъдат генерирани.
И накрая, като специален бонус, POV-Ray сцени могат да бъдат генерирани от текущия изглед, за да се направи зашеметяващ лъчи проследи качествени снимки.
Какво ново в тази версия:
- The тимин C6 атом сега е правилно въведен
- Фиксирана POV-Ray изход безкраен цикъл на PC версията
- Случайните катастрофата, докато записвате файловете ППБ (като 2i37) на компютъра е фиксиран
- Updated адреса на Uppsala Electron Density Карта сървър
Коментари не е намерена