LSim

LSim superposes макромолекулни електронни плътности и изчислява сходство полувремето структурен. Неговите изчисления мащаб линейно с размер на молекулите, които се сравняват.
Подравняванията LSim са концептуално са свързани с биохимични структурни елементи и следователно са непредубедени и подходящи само за структуроопределящи изследвания протеин сходство.
Монтаж:
Разопаковайте файла разпределение:
катран -xzvf lsim-linux.tar.gz
Преместване в файл директорията:
CD lsim.1.0.0
Копиране, преместване или връзка изпълнимия файл lsim на подходяща позиция; и се уверете, че lsim е достъпен чрез променлив околната среда PATH, например:
CP lsim / ЮЕсАр / местни / хамбар
Определете променлива LSIMDIR да сочи към директорията на мача LSim, например:
SetEnv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0