Bibliosphere Analysis Kit

Библиосфера предлага уникално съчетание на литературата-добивно и анализ пътека за молекулярни биолози, интересуващи се от генното регулиране и биологични мрежи.
 Библиосфера Пътека Edition използва обширна база данни на индивидуално моделирани взаимоотношения между гените, протеини, комплекси, клетки и тъкани, заедно с в крак с времето техники за извличане на текст за автоматизирано извличане на знания, за да ви позволи да се свържат данните си за биологични мрежи в различни биологични контексти.
 Използвайте Библиосфера да

• удължи биологични мрежи извън каноничната информация пътека (регулиране и метаболитен)
• обедините вашите високи резултати пропускателна с биологичен знания и последователност, базирани анализи
• изпълнява конкретния контекст чувствителен регулаторен анализ път
• генерират експеримента-конкретен начин на проникване варианти
• линк пътища към механизми и гени болестни
• направя напреднали експериментален дизайн

Какво ново в тази версия:

нови и усъвършенствани източници на данни

• Genomatix Expert куратор Gene-Gene Връзки:
   Genomatix интегрира своята фирмена база знания на експертни куратор данни за генна регулация в Библиосфера. Този уникален източник на данни, добавя семантиката на ген-генни взаимоотношения с динамично генерирани генни мрежи Библиосфера, предоставяне на информация, като "ген активира транскрипцията на ген B" или "Gene A физически взаимодейства с ген B".
  
• пътища на сигнална трансдукция:
   Части от Gene Онтология значение за сигнална трансдукция, както и данните, събрани от литературата са комбинирани, за да позволи идентификацията на каноничните пътища, свързани с фокусиран мрежа.
  
• метаболитен път асоциации:
   Метаболитен път асоциации са интегрирани, за да позволи идентифицирането на метаболитни събития, свързани с набор си на гени.
  

• Пътека Вижте с експертни куратор ген-генни връзки
   Гениите групи се събират в лесно разбираеми динамични мрежови графики, съчетаващи ръчни куратор ген-генни отношения с данни, получени от автоматизирано извличане на знания. Мрежите могат да бъдат персонализирани с филтри и фокусирани в ген, центриран начин за извършване на най-краткия анализ на пътя.
  
• Cellular Локализация View
   Въз основа на GO анотации гени са прехвърлени на субклетъчно тяхното местоположение и визуализира като оформление diagrammed клетки, което ви позволява да се идентифицират субклетъчни региони и отделни части от значение за вашата ген набор.
  

• Управление на проекти: Управление на вашите анализи чрез организирането им в папки в проекта. Бърз достъп до предишни резултати с няколко кликвания на мишката или да добавите нови търсения на съществуващите проекти.
  

• Различни малки подобрения и поправки на грешки

<силни> Изисквания :

• Mac OS X 10.2 или по-нова
• Java 1.4.1 (актуализация 1 се препоръчва)
• връзка с интернет
• сметка Genomatix оценка (безплатно)