Serial Cloner

Serial Cloner е софтуер, молекулярната биология. Тя осигурява средства с интуитивен интерфейс, който ви помага в ДНК клониране, анализ на последователността и визуализация. Serial Cloner е разработена, за да се осигури светло молекулярната биология софтуер за двете потребители на Macintosh и Windows. Serial Cloner чете и пише ДНК Strider (TM), съвместим файлове и за внос и износ на файлове в универсалния FASTA формат (както и в pDRAW32 формат). Мощни инструменти графичен дисплей и прости интерфейси помогнат за анализ и строителни стъпки (адаптер, PCR, Gateway [TM] клониране) в много интуитивен начин. Version 1.3 сега добавя виртуална машина, уеб браузър с незабавен внос на мненията NCBI / EMBL и мълчалив ограничение карта заедно с други подобрения.

Какво ново в тази версия:

• [NEW] Прогнозни Изоелектричното точка на протеинови последователности (ДНК и протеини Sequence Window)
• [NEW] MacOSX версия вече разпределена като подписано заявление (Mountain Lion Gatekeeper съвместимост)
• [мой] опция в Предпочитания за да изберете маси рК стойността да се използва за оценка р!
• [мой] опция в Preferences да използвате кода Кодонна от кодони таблици за използване като генетичен код, използван за превод
• [мой] опция в ограничаването Карта прозореца на само превод на нуклеотиди, които са с главни букви
• [мой] A / бутон меню, за да изберете конкретни обекти да бъдат показани в ограничителните карти.
• [мой] Сканиране за пептидни Удобства в протеинови последователности
• [мой] Наследи Особености при обратно превода ДНК последователност
• [мой] Бързото превключване между ДНК и протеини прозорец Align
• [мой] Non форматиран копие на протеинова последователност (копирате повече ... Menu)
• [мой] Наследи Особености при копиране / поставяне протеинови последователности
• [мой] Функции на екрана в Protein Align (Local Align)
• [мой] A бутон за превключване да подчертае различията в съответствие от протеини
• [мой] за пръв път (S), за да покаже бързо или маска функции (в раздела на Sequence Windows Характеристики)
• [мой] "Котва" и домейни от праймери ядро ​​от предприятието се признават като Удобства в Sequence Windows
• [мой] A бутон, за да изберете бързо пълна линейна посочете в прозореца "Изграждане на Construct"
• [мой] Added пряк път към "Copy Non форматиран" [COMMAND-SHIFT-K]
• [мой] A влизане меню, за да отидете на Serial Cloner форум
• [мой] влизане A меню, за да отидете на Serial Cloner Youtube канал (урок)
• [АКТУАЛИЗИРАНА] Това вече е възможно да промените размера напълно Последователност прозорци
• [актуализирани] Отсъстващи сайтове са посочени в курсив в ензимните за избор на прозорци (графични и ограничаването Maps)
• [актуализирани] Уникални сайтове са посочени в удебелен шрифт в ензимните за избор на прозорци (графични и ограничаването Maps)
• [АКТУАЛИЗИРАНА] разбор на NCBI последователности (Web Access) да се вземат в предвид промените в NCBI страници.
• [АКТУАЛИЗИРАНА] Подобрена разбор на последователности, съдържащи "х" в нуклеотидната последователност
• [АКТУАЛИЗИРАНА] Променена пряк път на "Copy Всички последователности, за да Multifasta" да [COMMAND-SHIFT-J] вместо [COMMAND-SHIFT-K]
• [ОТСТРАНЕНИ] A Windows-специфичен интерфейс бъг на прозореца "Import Кодонна отклонение"
• [ОТСТРАНЕНИ] Бъг понякога предотвратява правилното копие на изображения (Graphic картата, Virtual Cut, shRNA) в клипборда (Windows специфична)
• [ОТСТРАНЕНИ] A проблем, възникнал с необичайни имена са като R1.BceSIV в частност ензим "опцията за избор на Graphic картата.
• [ОТСТРАНЕНИ] Проблем [Gateway Клониране] с индикация Характеристики, когато векторът на дестинация е безмислена (att2-att1 посока)
• [ОТСТРАНЕНИ] Бъг в избора на най-използваните ОО когато обратен превод
• [ОТСТРАНЕНИ] Проблем с последователно и протеини прозорци "Избери всички"
• [ОТСТРАНЕНИ] проблем файлов тип, свързан към сериен Cloner файлове (чупене съвместимост с Sequencher внос в частност)
• [ОТСТРАНЕНИ] Ligation: Понякога ненужно произведено дегенеративен DNA
• [ОТСТРАНЕНИ] Gateway: генериран ДНК, но след това, когато ще се запише като неизвестен тип
• [ОТСТРАНЕНИ] PCR:. Ако се прави на "неизвестен формат" последователност, неправилно генериран "Протеин" тип
• [ОТСТРАНЕНИ] A проблем актуализиране Feature, когато се развали изменение
• [ОТСТРАНЕНИ] Когато поставите последователност протеин в GenBank формат (NCBI) прозорец протеин последователност е вече правилно създадена.
• [ОТСТРАНЕНИ] проблем с NCBI BLAST сървър при използване на не-ASCII символи последователно имена
• [ОТСТРАНЕНИ] Проблем с дисплей Feature след сканиране, когато се намери само една Feature
• [ОТСТРАНЕНИ] Рядък проблем на дисплея Feature в прозореца Construct
• [ОТСТРАНЕНИ] Един от проблемите на опресняване при използване размер характер, различен от 01:02 PT в графични карти.
• [ОТСТРАНЕНИ] бъг в прозорците ограничението картата, където на първа линия на превод аминокиселина е преместена в режим кодон
• [ОТСТРАНЕНИ] Бъг свързани предотвратяване на използването на избраните преди ензими в Virtual Cutter прозорец