Най-доброто биоинформатиката за Linux
Genepidgin е пакет от Python инструменти, които помагат за оценка и възлагане генни имена на продукти & Nbsp; Има три основни компонента.:genepidgin * чисти *& Nbsp; стандартизира генни имена на насоки UNIPROT именуванеgenepidgin * сравни *& Nbsp;...
СТЪПКИ е пакет за точната стохастично симулиране на реакция-дифузия системи в произволно сложни 3D геометрия. Нашата основна симулация алгоритъм е реализация на SSA Гилеспи, разширен, за да се справят с дифузия на молекули над елементите на 3D тетраедърна...
TRMiner е Python програма, която има за цел научни куратори данни & Nbsp;. Тя позволява бързо да се режат на големи колекции на научни публикации да присъди съответните за дадена минна гол.Това се постига в два етапа. Първо, текстове са tranlated в...
Benchmark Системата за биоинформатика е опит да се изгради един разумен тестване рамка, тестове, както и данни, за да се даде възможност на крайните потребители и търговци, да вникне изпълнението на техните системи.Това, което ние се опитваме да направим,...
Staden Package е напълно разработен набор от сглобяване ДНК последователност (Gap4), редактиране и инструменти за анализ (спин) за Unix, Linux, MacOSX и MS Windows.На предната Gap4 е имало няколко незначителни присъедини отнасящподобрения в начина, по...
Arem е базиран на MACS (модел, базиран анализ за чип Послед данни).Висока пропускателна секвениране свързан с хроматин имуно утаяване (чип Seq) е широко използван в характеризиращи целия геном свързващи модели на транскрипционни фактори, кофактори,...
seriesoftubes е продължителен тръбопровод за Solexa чип сл данни.Комплект документи
Изисквания :
...
MetagenomeDB е Python библиотека, предназначена да лесно да се съхранява, извличане и поясняват Метагеномно последователности & Nbsp;. MetagenomeDB действат като абстракция слой отгоре на база данни MongoDB. Тя предоставя API да създавате и променяте и да...
Seal е Python модул, който осигурява подреждането на Hadoop.Seal е на MapReduce заявление за привеждане в съответствие на биологичното последователност. Тя работи на Hadoop (http://hadoop.apache.org) чрез Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), а Python...
Мишо (смес от Изоформи) е вероятностна рамка написан на Python, че quantitates ниво & Nbsp на изразяване; на алтернативно снадени гени от РНК-Послед данни, и определя диференцирано регулираните изоформи или екзони цяла проби.Чрез моделиране на генеративен...