ZOOM Lite е картографиране секвениране на данни и софтуер за визуализация от следващо поколение. Референтни геноми Потребители вход и Illumina / Solexa кратко чете файлове или AB плътен цвят пространство чете файлове в различни формати, като например * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta др ZOOM извежда резултатите от картографирането на тези кратко чете на референтната последователност. ZOOM Lite има бързо и точно картографиране на ядрото на базата на новия дизайн на множество разположени семена теория. Единични, така и в края на сдвоени край чете на различни дължини от могат да бъдат манипулирани 15Ьр да 240bp. Е позволено да има произволен брой несъответствия и един вкарване / заличаване на различни дължини между четене и си целевия регион на референтната последователност. Уникално картографирани резултати или най-добрите (топ N) резултати за всяка четене ще бъдат докладвани в съответствие с минимални несъответствия и продължителност на INDEL. Качествен рейтинг се използват за подобряване на точността картографиране. Въз основа на ядрото картографиране, ZOOM Lite позволява на потребителите да зареждат местните четене на данни и данни референтна последователност, изберете подходящите параметри, данни процес с голям обем в паралел между до четири процесора, следят задачите на текущите, съхранява резултатите от картографирането, вижте графиките на резултати картографиране и резултати изход картиране в нито * .BED или * .GFF файлови формати за по-нататъшно проучване с информацията браузър следа UCSC. Обобщението на резултатите могат да се видят във всяка желана мащаб, от дълбочина четене графиката на над цяла хромозома детайлната подреждане на последователностите между чете и последователността за сравнение. Потребителите лесно да навигирате към региони на интереси просто чрез щракване и плъзгане или превъртане. ZOOM Lite е производно на ZOOM Studio софтуер
Какво ново в тази версия:.
Версия 1.5 включва SAM износ формат, архитектура коригира, по-добра оптимизация на кода, по-малък програма двоичен размер и модернизирани dabase engining за по-добра производителност.
Коментари не е намерена