В SPInDel е алтернативен подход за биологична идентификация на базата на продължителността на рибозомна РНК (иРНК) генни региони. Като цяло, изравнявания на първичния рРНК генни последователности от различни видове са показали, редуващи се участъци на опазване нуклеотид и вариации, както по отношение на нуклеотидни замествания (наричани общо "SNPs") и поставяне / заличаване (INDEL) събития. Наличието на indels резултати в последователности с различни дължини и въвежда пропуски в съгласуването, обикновено обозначени с тире "-".
Нашата концепция за биологично идентификация използва рРНК генни последователности, както следва: съхранени области се използват за определяне на променливите сегменти ("SPInDel хиперпроменливи области"), в която комбинация от последователност дължини е характерно за всеки вид (A "SPInDel профил"). По този начин, всеки вид могат да бъдат определени от уникален цифров профил.
На теория, изследване на само 6 хиперпроменливи региони с по 20 алели всеки (или 11 региона с 5 алели всяка) е достатъчно да се дискриминират всички еукариотни видове на земята, което се очаква да бъде между 5 и 15 милиона в брой. На практика SPInDel е в състояние да разграничи със ниска вътревидови вариация и висока филогенетичното резолюция 93,3% на еукариотни видове.
Коментари не е намерена