MacMolPlt

MacMolPlt е Chemistry визуализация инструмент, който може да се използва за изграждане на молекули с интегриран графичен модел строител, създаване на входни файлове за компютърна програма, химия на GAMESS, а след това се визуализира резултатите от компютърна химия писти. Характеристиките включват 3D дисплей висококачествено, анимации на нормален режим и реакционни последователности и подаде към различни формати, включително висококачествени изображения и QuickTime и Flash филми.

• Input използване:
• MolPlt файлов формат продупчен от GAMESS
• чрез поставяне в декартови координати от всеки GAMESS или Gaussian лог файл
• всеки GAMESS вход, влезте или IRC файл
• Xmol стил XYZ файл
• MolDen файлове във формат
• Protein Data Bank (PDB ) подаде
• Chemical Markup Language (CML) файлове
• Изграждане графично с интерактивна молекула редактор
• Изграждане на ръка с помощта на декартови или Z-матрица стил вътрешни координати
• 3D дисплей на структурата и нормален режим
• Animation на нормален режим.
• 3D ротация в реално време и преводачески услуги, по мишка
• Изчисляване на всеки Z-матрица параметър
• Визуално мярка / дисплей разстояния, ъгли и винкели.
• Автоматизирано създаване на линейно-слабо движение (LLM) пътеки
<Ли > 2D и 3D Изчисляване и показване на:
• Molecular орбитали (АО, Мо, или ОПТ'S)
• Общ електронната плътност
• Плътност разлики
• Molecular електростатични потенциали (MEPMaps)
• Basic входен файл генератор за GAMESS
• OpenGL използва за висококачествено 3D рендериране
• Подкрепа за молекулна симетрия
• Генериране на симетрия зависими атоми
• Определя симетрия уникални атоми
• Автоматично определяне на списъка на поддържаните точкови групи за набор от координати.
• Rotate координати в правилното принцип ориентация
• Display симетрия оператори за много точкови групи
• качеството Публикуване изход (цветно или черно-бяло) чрез директен печат или Copy и Paste в друго приложение.
• Output в най-различни форми, включително Windows растерна графика, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Флаш Филми и QuickTime филми.

Какво ново в тази версия:

няколко подобрения са направени на кода на езика. Опции са били добавени към 3D панел на prefernces за плавно преливащи с и без сенки.
Добавена елементарна поддръжка за Mopac файлове.
Добавена възможност да превключвате видимостта на самото начало, MM, и EFP атома.
Подобрена поддръжка за Изолационна потенциал.
Добавен кука във входната строител за новата програма GAMESSQ.
Подобрена ППБ файл парсера.