Arabidopsis Motif Scanner (AMS) е приложение за Windows, която работи на местните компютри. Тя е разработена, за да се изгради генни мрежи чрез идентифициране на позициите на цис-регулаторни елементи в Arabidopsis thaliana на модел на растенията и чрез осигуряване на лесен интерфейс за оценка и оценка на генни взаимоотношения. Неговият основен иновационен функция е да се комбинират цис-регулаторен елемент позиции, NGS и ДНК чип масиви експресивни данни, Arabidopsis анотации и генни взаимодействия за идентифициране на генни мрежи регулирани от транскрипционни фактори. В проучвания, фокусирани върху функцията на транскрипционни фактори, софтуерът използва данните на изразяване и задължителен мотиви за сайтове с регулативните генни региони, за да се предскаже директни целеви гени. Освен това, AMS използва данни ДНК-протеин и proteinprotein взаимодействия да се улесни идентифицирането на метаболитните процеси, регулирани от фактора на транскрипция на интереси.
Коментари не е намерена