Нов биоинформатиката за Linux
СТЪПКИ е пакет за точната стохастично симулиране на реакция-дифузия системи в произволно сложни 3D геометрия. Нашата основна симулация алгоритъм е реализация на SSA Гилеспи, разширен, за да се справят с дифузия на молекули над елементите на 3D тетраедърна...
NEO (Neural Ансамбъл Objects) и е проект за създаване на общ набор от базови класове, за да се използва в невронната анализ на данни, с цел получаване на OpenElectrophy, NeuroTools и може би други проекти със сходни цели по-близо един до друг.Две основни...
OpenElectrophy е рамка за улесняване на манипулирането, съхраняване и анализ на електрофизиологични данни. Тя може да импортирате данни от много различни файлови формати и да ги съхранявате в един SQL тип база данни.Инструменти за анализ, включени в...
ТОРФА е пакет от програми за улавяне, прогнозиране и анализ на биофизични характеристики на протеини.Вижте http://enzyme.ucd.ie/PEAT за документация, инструкции, снимки на екрани и др Изисквания :. ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) е ефективна програма, която е наравно относително къси нуклеотидни последователности срещу дълга референтна последователност като човешкия геном.Софтуерът изпълнява два алгоритъма, BWA-кратко и BWA-ЮЗ. Бившите работите за...
SSuMMo е библиотека от функции, предназначени около итеративно използване hmmer да зададете последователности на таксони & Nbsp;. Резултатите са силно анотирани дървета, показващи вида / дистрибуция род в рамките на тази общност.Програми, включени с...
попчета е Python API за четене на бинарни файлове с данни, създадени с помощта рамка за управление на данните попче следващото поколение.Обикновено, тази директория идва като част от целия пакет попче, на разположение от:& Nbsp; HTTP:...
PySCeS е проект, разработен от Triple-J Групата за Molecular Cell Physiology & Nbsp;., За да се опита модел и да разберат сложните процеси и системи, които съставляват живата клетка Характеристики :. A текст базирани описание модел език A...
Pysam е Python модул за четене и манипулиране Samfiles & Nbsp;. Това е олекотена обвивка на samtools C-API.Ръководството за бърз старт е тук. По-подробна документация е на разположение тук.Въпроси и коментари са добре дошли и трябва да се изпращат на...
TRMiner е Python програма, която има за цел научни куратори данни & Nbsp;. Тя позволява бързо да се режат на големи колекции на научни публикации да присъди съответните за дадена минна гол.Това се постига в два етапа. Първо, текстове са tranlated в...