QuasiRecomb

QuasiRecomb е лека програма, която се изпълнява в командната конзола, която симулира модел Марков за генериране на вирусни квазивиодове. Той описва получаването на вирусни квазивидове и метод да се направи извод, неговите параметри чрез анализиране на данни за секвениране от ново поколение. Моделът е валидирано на симулирани данни, показващи предимството изрично като процес на рекомбинация предвид, и тестван чрез прилагане към прочитания получени от експериментални HIV проби. Той разполага с прилагането на алгоритъма за EM да намерите максимални оценки впоследствие на параметрите на модела и метод за оценка на разпространението на вирусни щамове в квазивидове

<силни> Изисквания :.

Java