MultiDendrograms

MultiDendrograms е прост, но мощно приложение, за да йерархичната струпване на реални данни, разпределени по силата на лиценз с отворен код & Nbsp;. Започвайки от разстояние (или тежести) матрица, MultiDendrograms изчислява своя Дендрограма използване на най-често срещаните алгоритми Agglomerative Йерархично Clustering , позволява настройка на много от графичните параметри представителство, а резултатите могат лесно да бъдат изнесени във файл. Резюме на характеристиките:
- Мултиплатформени: разработени в Java, работи във всички операционни системи (например Windows, Linux и MacOS).
- Графичен потребителски интерфейс: подбор на данни, йерархични възможности клъстери, Дендрограма представителни параметри, навигация в дендрограмата, мерки отклонение.
- Йерархични Clustering алгоритми приложени: променлива група Single връзка, Complete връзка, Непретеглен средните, среднопретеглената, Непретеглен медицентър, Weighted медицентър и фуга между-срок.
- представителни параметри: размер, ориентация, етикети, ос, и т.н.
- Мерки за отклонение: Cophenetic Корелация коефициент Нормализирано Mean Squared грешка и Нормализирано Средната абсолютна грешка.
- Export: ultrametric матрица, подробности Дендрограма в текстов и Newick дървесни формати.
- Парцел: Дендрограма изображение в JPG, PNG и EPS формати.
MultiDendrograms прилага променлив групата алгоритми за решаване на проблема с не-уникалност намерено в стандартните алгоритми и реализации в двойка група. Този проблем възниква, когато две или повече минимални разстояния между различни групи са равни по време на процеса на обединение. Стандартният подход се състои в избора на чифт, чупене на връзките между разстояния, и продължава по същия начин, докато се получи крайния йерархическата класификация. Въпреки това, различни clusterings са възможни в зависимост от критерия, използван да се прекъсне връзките (обикновено един чифт е просто произволно избрани!).
Групата с променлив групови алгоритми повече от два клъстера, в същото време, когато се появят връзки, довели до графично представяне нарича multidendrogram. Техните основни свойства са:
- Когато няма връзки, алгоритми за променлив групови дават същите резултати като тези, двойката на групировката.
- Те винаги се даде еднозначно определя разтвор.
- В представителството multidendrogram за резултатите може изрично да се наблюдава поява на връзки по време на agglomerative процес. Освен това височината на всеки интервал от термоядрен синтез (лентите в програмата) показва степента на хетерогенност вътре в съответния клъстер

<силни> Изисквания :.

<ул >