InterMine

InterMine предвижда съчетания достъп до datawarehouses задвижвани от InterMine технология.
InterMine е мощен отворен код за съхранение на данни система. Използването InterMine, можете да създадете база данни за биологични данни достъпни чрез усъвършенствани инструменти за уеб заявки. Парсери са предвидени за интегриране на данни от няколко общи биологични формати и има рамка за добавяне на ваши собствени данни. InterMine включва атрактивен, лесен за употреба уеб интерфейс, който работи "извън кутията" и могат лесно да бъдат персонализирани за вашите специфични нужди.
All InterMine код е свободно достъпен под лиценза LGPL

Какво ново в тази версия:.

• Свързване, за да InterMine:
• Има няколко нови начини за свързване на вашия Mine. Вижте връзки за детайли.
• Web услуги JSON формат:
• Има няколко формата нови резултати WebService. Присъединявайки jsonobjects които се появиха в 0.95, сега ние имаме JSON формат за почти всичко останало:
• Резултати:
• jsonrows - табличен представяне на данни с допълнителни мета-данни
• & quot; jsontable & quot; . - Контейнер формат за изграждане на вградени шаблони (виж: залагането на урок)
• & quot; броене & quot; и & quot; jsoncount & quot; - Формати за просто получаване на броя на заявките
• Webservice мета-данни (модел и шаблони):
• & quot; JSON & quot; - Лесно анализируем версии на модела на данните и достъпно списъка шаблон
• Authentication сега работи в Perl Webservice Клиент:
• Потребителите на клиента Perl Webservice сега имат програмен достъп до техните списъци и частни шаблони. Просто предостави данните си за вход към клиента, за да влезете в профила си (ваши данни се предават в криптиран формат). Тази функция ще работи с всички мини с уеб услугите, а не само тези, в 0.96 и нагоре.
• Object резултати с Webservice Клиенти:
• Клиентите на Perl и Java са в състояние да получите резултати назад като обекти (JSON Objects, или в Perl, напомпани до пълните обекти резултат). Това опростява някои сложни въпроси за обработка на данни, както и справяне с външния присъединява и колекции.
• вградени таблици:
• Вече можете да вградите роден таблици с данни от всяка мина с подкрепата WebService в уеб страниците си с JavaScript и CSS. Виж на залагането на самоучителя за демонстрация и въведение към тази техника. Не забравяйте да си поиграете с новия JavaScript библиотека на разположение на http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Registry:
• Ние стартирахме централна регистрация услуга за InterMine реализации. Това не само ще служи като & quot; Жълти страници & quot ;, позволява на посетителите да открият нови данни-източници, както и улесняване на синхрона между самите мините, но тя също така подкрепя уеб услугите чрез осигуряване на регистър на URL адреси WebService и версии. Посещение на системния регистър в http://www.intermine.org/registry, и за помощ при регистрирането на вашия собствен мина, посетете RegisteringYourMine.
• Link Redirects:
• Можете да добавите имот да имат връзки в резултатите страници пренасочват към всеки URL. Вижте LinkRedirects за повече информация.

Съдържание
• Начална страница:
• Началната страница за InterMine вече може да бъде конфигуриран да показва различна информация въз основа на това дали потребителят е нова. Вижте HomepageConfig за инструкции как да конфигурирате това поведение.
• New етикет:
• Добавихме нов етикет: IM: Админ. Ако маркирате шаблон с IM: администратор, той няма да се появи във вашия уеб приложение. Това е полезно за скриване на шаблони, необходими на уеб услугите InterMine е от вашите потребители. Вижте Маркиране на списък на всички налични етикети.
• качете списък:
• Процесът на качване списък е подобрен.
• Други промени:
• UPDATE - по-строг корекция многократни изпитания хипотеза за обогатяване джаджи. & Quot; Брой тестове & quot; Сега е броят на термини, свързани с референтния списък.
• UPDATE - по-полезни опции за филтриране на обогатяване джаджи
• NEW - Холм-Bonferroni опция добавя към обогатяване джаджи
• UPDATE - нов & quot; изтриете & quot; бутон на списъци страница
• Update - взаимодействия Displayer зарежда чрез AJAX така докладва страница се зарежда по-бързо
• FIX - & quot; полувремето & quot; изображения показващи правилно на резултатите от търсенето
• UPDATE - QueryBuilder по-интерактивни, избор на елемент от списъка ще се върне към първоначалния елемент след страница на опресняване / презареждане
• UPDATE - линк добавен в резюме колона в резултатите от заявката, вземане е по-лесно да видите различни стойности
• FIX - вход бъг относно малки и главни букви имената на потребителите
• FIX - джаджа бъг при гледане след експорт на данни джаджа
• NEW - заявки шаблонни са подредени по популярност, освен ако не сте влезли в системата, като в този случай те са подредени по дата всяка заявка е последното изпълнение
• Фикс - данните не се повтарят в & quot; разни & quot; раздел относно доклада страници
• Фикс - шаблони показват правилно на доклад страница дори за подкласове
• FIX - шаблони правилно представяне върху аспект страници
• UPDATE - актуализиран BioGRID Конвертор да се справят с промените в новите файлове с данни
• FIX - различните & quot; златото & quot; Темата CSS и изображения е подобрен и актуализиран
• FIX - въпрос темата безопасност разгледани в шаблона проследяване
• UPDATE - Таблица джаджи да групирате от атрибут, както и клас

<силни> Изисквания :

• Python