Ghemical

Ghemical е компютърна химия софтуерен пакет разпространява под GNU GPL. Това означава, че пълното изходния код на пакета е на разположение, и потребителите са свободни да учат и променяте пакета. Ghemical е написан на C ++.
Ghemical проект има графичен потребителски интерфейс (който се основава на GNOME), и да го поддържа и двата квантовата механика (полу-емпирични и от самото начало) макети и модели молекулна механика (има експериментален Tripos 5.2-като силово поле за биологично molecu Също инструмент за намалените модели протеинови [1] е включена. оптимизация Geometry, молекулярна динамика и голям набор от инструменти за визуализация в момента са на разположение.
Ghemical разчита на външен код, за да осигурят изчисленията на квантовите механични. Полуемпиричните методи MNDO, Mindo / 3, AM1 и PM3 идват от пакета за MOPAC7 (Public Domain), и са включени в дистрибуцията на сорса.
Пакетът MPQC (GNU GPL) се използват за осигуряване на самото начало методи: методите, основани на Hartree-Fock теория момента се поддържат с базисни набори, вариращи от STO-3G да 6-31G **.
Кодът на MPQC не е включена в дистрибуцията на сорса. За да използвате MPQC базираната в самото начало методи в Ghemical, първо трябва да се съберат и да инсталирате програмата MPQC за вашата система, и след това се съберат Ghemical използват някои специфични настройки, които сочат програмите заедно; виж на инсталационния файл за повече информация. Ghemical също съдържа опаковката OpenBabel за внос и износ на много различни файлови формати (както и други задачи).
Монтаж
След като сте изтеглили най-новата версия, трябва да разархивирате файлове от вашия архив файл с помощта на "катран -zxvvf ghemical-1.00.tgz" или еквивалентно "gunzip ghemical-1.00.tgz; катран -xvvf ghemical-1.00.tar". След това моля прочетете "Install" -file просто извлича, за да получите допълнителна информация.
Какво е новото в тази версия: