Gephi

Gephi е инструмент за внос, да изследват, манипулират, да анализира, филтър, clusterize, spatialise и износ на големи графики и мрежи

Какво ново в тази версия:.

• Тази версия акцент върху новите функции за потребителите, така и за разработчици, както и на новия лиценз отключва възможности за бизнес. Класацията и Преглед модули са напълно пренаписана в модулен начин и сега може да бъде удължен с плъгини! Preview вече може да бъде удължен по много начини, например групови форми или ръб пакетна продажба. Освен това са направени непрекъснат напредък по динамична подкрепа на мрежата и да освободим днес последната голяма част: статистика с течение на времето, на разположение от статистика модул, когато мрежата е динамичен. Благодарение на потребителите, които са съобщили бъгове, това е единственият начин да ги поправи.

Какво ново във версия 0.7 Beta:

• Нови функции:
• New Laboratory Data (манипулират колони, търсене / замяна, Merge, Sparklines ...)
• Надлъжно мрежа визуализация, топология променя с течение на времето, както и атрибути
• Timeline вече работи правилно, се появява автоматично, когато графиката е динамична, един бутон, за да се даде възможност за филтриране
• Show / Hide етикети от филтри - може да се нулира от "Reset Visible" действие (от ляво на графика прозорец)
• Display ръба на тегло като етикети за визуализация
• New Stax GEXF вносител и износител, с йерархия и динамична подкрепа
• New Списък / Масивите приписват видове. Може ли да се внасят само от GEXF за сега.
• NOT оператор (филтри)
• МАСКА оператор (филтри) - пазят ръбове според източник / целева / и двете / всеки - лесно може да се получи съседи от един набор от възли
• Изравняване на Filter - Изравняване на йерархична графика на видимата гледката, трансформиране мета-ръбове в нормални ръбове
• New Giant Component Filter
• Time Frame внос, нова опция в "Внос на отчет" за внос на последователни статични файлове и да се превърне в динамична
• Zoom слайдер с опции за визуализация
• опция "внос липсващите възли" в доклада за внос - изберете дали да ги създават, или не
• Set размер за действието "Reset Size", кликнете с десен бутон върху бутона за нулиране размер
• Get степен колона от неориентирани графа
• Статистика докладите сега запазена в проекти Gephi
• опцията New "премащабира Тегло" в Preview, за да принуди тегло изглежда по същия начин, както Преглед
• New 'Original' вариант за ръбове цвят в Preview, запазва оригиналния цвят ръб, идващи от Partition например
• копирате и премествате възли с нов или съществуващ работно пространство
• Нови Визуализация пресети
• Локализация сега е възможно, и за промяна на езика от Gephi
• Когато се установи, успоредни ръбове по време на вноса, то сега се увеличава теглото на ръба по подразбиране
• Option в Ego Филтър за включване на майка възел или не
• мета-ръбове имат сега отделна скала слайдер в настройките за визуализация, промени начина, дебела те са в сравнение с нормалните ръбове
• класиране и Partition списък от атрибути сега са сортирани
• Класиране сега се обновява с филтрирани графики. Кликвайки върху Apply ще обнови граници и трансформацията (цвят, размер) е вярна
• Вече е възможно да плъзнете филтър под заявка за да се превърне в основна заявка
• С динамични качества, класиране, Partition, визуализация и Филтри ще използват сегашната гама Timeline да намерите стойности
• Edge тегло може да бъде динамична, тип DYNAMIC_FLOAT. Force Atlas оформление ще използва обхватът на тока Timeline
• Филтрите са освежени, когато графиката е модифициран, текущия филтър е reexecuted
• Локализация сега е възможно, френски и испански език, ще бъдат достъпни скоро
• Фиксирани бъгове:
• Wrong ръб отстранен от Edge Тегло филтър (бъг 603,469)
• Филтриране с изпъкнали корпуси, показвани (бъг 541,819)
• NullPointerException когато филтриране неориентирани графа (бъг 571,153)
• NullPointerException за внос динамична графика (бъг 581,872)
• GTK + слайдер проблем (бъг 529,913)
• мета-ръбове не се извеждат (бъг 584,283)
• Preview не показва мета-ръбове (бъг 584,289)
• Грешки с Yifan Hu многостепенното Layout върху филтрира графика (бъг 594,643)
• Size Node режим и филтриращи Paramaters не спести в проекта (бъг 596,430)
• Leak Memory в GEXF / GraphML Parser (бъг 596,872)
• Неправилно взаимно ръба на теглото върху Preview (бъг 610,469)
• Progress не се показва, когато отваряте / запазване на проекта (бъг 594,644)
• Не може да отмени отварянето на проекта (бъг 616,415)
• Бавна за бране на запис за дял (бъг 519,549)
• Configuration EdgeList Database не се запаметява (бъг 571,263)
• "Старт" и атрибути "крайни" са изчезнали при износа динамична GEXF (бъг 521,848)
• Partition & quot; Всички Черни & quot; функция произволност цветове (бъг 601,066)
• Филтрирани графика не се изнася с & quot; Select & quot; натиснат (бъг 573,685)
• Settings Преградни в Filter не записани на превключване работни пространства (Bug 616052)
• Откриване Архивирани ZIP файлове е счупен (бъг 578,876)
• Exception на натискане на бутона "Йерархия" по време на движение на многостепенното оформление (бъг 631,663)

Данни
• GraphML вносител не внасят етикети възел (бъг 581,629)
• не може да спаси / спестява както при отваряне на Gephi от DoubleClick графика в Windows (бъг 583,397)
• ForceAtlas и Fruchterman Reingold не layouting с мета-ръбове (Bug 584286)
• Leak Memory в Graph Разстояние (бъг 587,450)
• NullPointerException при изпълнение на & quot; собствен вектор централното място & quot; Статистика (бъг 589,731)
• NullPointerException при превключване между работните пространства, докато оформление работи (бъг 597,458)
• Не мога да плъзнете филтър под-заявка да се превърне в корена заявка (бъг 626,495)
• Класиране параметри повторно инициализиран при всяко ново класиране (бъг 594,231)
• подреждане, не освежени, когато графика филтрира (бъг 632,459)
• Node невидима (твърде малък), когато е създадена с молива на възела (бъг 574,807)
• Грешка при отваряне Plugin Center (бъг 616,829)
• Не можете да изберете PostgreSQL водача в настройките на база данни за внос (бъг 595,223)
• не може да покаже ръба на тегло като текст (бъг 603,134)
• Import трансформиране да неориентирани не се слеят тегло (бъг 603,478)
• Кликнете с десния бутон върху работното пространство, след като заличи възел хвърля & quot; възел не може да бъде нула & quot; (Бъг 605,947)
• In / Out степен показател не работи с неориентирани графа (Bug 606305)
• NullPointerException при избора на & quot; - Изберете Layout & quot; в ComboBox на Layout (бъг 606,964)
• Selection Workspace не успя да освежи след затварянето на работното място (бъг 616,814)
• селекция Визуално инверсия на цветовете между "вън" и "както" цвят (бъг 618,726)
• "Format" не признават на DL внос (бъг 619,069)
• Edit прозорец не крият в табове (бъг 552,494)
• динамична графика непризнатата ако вечните възли (бъг 555,637)
• FileNotFoundException по време на запазване на PDF файл (бъг 572,876)
• & quot; Node трябва да е в графиката & quot; Грешка при импортиране йерархична графика с височина по-голяма от 1 (бъг 577,180)
• Auto мащаб обръща графиката (бъг 577,843)
• Невъзможно е да се откажете Средна дължина на пътя Статистика изчисление (бъг 590,226)
• съотношение не е на разположение на първо време Preview (бъг 594,176)
• селекция Default на възли в лабораторни данни, необходими (бъг 594,515)
• & quot; CommandLineParsing нищожна & quot; съобщение, когато грешка при отварянето на файлове от командния ред или настолен (бъг 594,630)
• няма да бъде внесен в същия файл два пъти в Welcome прозорец (бъг 598,157)
• CSV файл износ проблем (бъг 598,767)
• Не мога близо проект, когато се генерира графика (бъг 631,341)
• ограничение Визуално (бъг 602,470)
• дублиран етикет филтър прозорец (бъг 604,003)
• Дяловете не се освежат, когато отваряте проект не от Обзор (бъг 612,902)
• Z-координатата не е изнесено в GraphML (бъг 614,606)
• неправилни позиции възел при определянето на X или Y до нула (бъг 615,844)
• Избрани заявка филтър не е правилно освежени в UI (бъг 626,483)
• Експорт в PDF фон е винаги бяло (бъг 583,386)
• SVG файлове, неописани в диалоговия Export (бъг 626,394)
• грешен размер възел, когато класира има същия мин и максимален размер (бъг 631,689)
• Прочетете позиции от точка файлове (Bug 594793)
• Класиране и параметри Преградни не списъка подредени (бъг 594,520)
• Node степен не в Label Настройки на текст (Bug 598170)
• Wrong папка избран в износа панел при смяна на типа на файла (бъг 620,337)
• Генериране на графика по-рано зареден ненасочена графика (бъг 624,671)
• Wrong инсулт тегло, когато SVG внесени в Illustrator (бъг 626,378)
• Филтриране не освежени, когато под-заявки, установени или премахнати (бъг 594,511)
• Грешки при PDF износ, когато етикетите имат размер на шрифта нула (бъг 626,865)
• Текст, не се показва в Preview (бъг 627,567)
• Edges родния цвят не се показват в Preview (бъг 586,237)
• десетобалната Edge тегло е различно между Graph и Preview (бъг 569,329)
• Отрицателни ръбове не топени в Preview (бъг 628,223)

Тегло
• Edges не се слива с паралелни ръбове (Bug 648600)
• филтър Partition автоматично филтрира нулева стойност (бъг 648,600)
• Exception на файл отваряне проект (бъг 648,617)
• Ego Filter не включва самия възел (бъг 649,908)
• PDF Export само с по подразбиране шрифт (бъг 651,273)
• възли не немаркиран след изключване Избор на Филтър Panel (бъг 649,920)
• API
• Add метод изравнявам (), за да HierarchicalGraph да изравнявам йерархична графиката и трансформиране мета ръбове в обикновени ръбове.
• Добави унищожи (Filter филтър) в FilterBuilder да получите известие, когато заявката за филтър се отстранява и за почистване.
• Добави MetaEdgeBuilder в Graph SPI да позволи по поръчка строители. Добави GraphSettings.setMetaEdgeBuilder () в настройките на графика на модела.
• Modify StatisticsModel да съхранявате доклади директно вместо Статистика инстанция. В резултат на това, моделът вече има getReport () и метод getResult () UI, че може да се използва. В момента вървят статистиката сега може да се получи с метод нова getRunning ().
• опростяване и подобряване на управлението на атрибутите събития. Слушателите на събития вече се абонират директно от AttributeModel вместо AttributeTable и ще получат събития за всички маси. Редакции на класа AttributeEvent с AttributeTable като източник и нов AttributeEventData обект, както на данните. Нов SET_VALUE е изпълнена за получаване на събития, когато са зададени стойности на атрибутите.
• Промени в AttributeRowFactory, методът на newNodeRow () сега е на собственика обекта NodeData като параметър. По същия начин за newEdgeRow () и newRowForTable ().
• Добави getEdge (Node, Node) в GraphAPI съображения за последователност.
• Промени в Processor SPI. Преработвателят е сега създателите вместо процес () метод с параметри. Как се създават процесори остава същата. Създаване на ProcessorUI интерфейс за конфигуриране на настройките процесори. Изпълнение A ProcessorUI осигурява панел, който се показва, когато докладът за внос се затваря. The ProcessorUI също така позволява да забраните процесор с някои условия.
• Добави getColor () метод в NodeDraft и EdgeDraft.
• Дефиниране на & quot; Преглед, & quot; лаборатория Data & quot; и & quot; Preview & quot; както перспективи. Създаване на нов SPI за perspecives и членове перспектива. Членове са просто TopComponent, че принадлежат към една гледна точка. Plugins могат да приложат PerspectiveMember да се дефинира отварят и затварят поведение.
• Добави видове списък / масиви в атрибутите API. Всички местни видове работи в момента по сродна тип списък, освен динамичните видове. Видовете списък наследява AbstractList.
• промени в начина Import API занимава с времеви интервали и динамични данни. Подкрепа за динамичните качества е добавен с нов addAttributeValue () метод в NodeDraft и EdgeDraft. За подобряване на възможностите за почистване на данни, NodeDraftGetter и EdgeDraftgetter сега връща AttributeRow вместо списък само стойности на атрибутите. И накрая, за да се възползват от най-новите подобрения, проекти на елементи връща директно на TimeInterval тип вместо списъка на филийки. Методи с "Slice" са преименувани на "Interval" съображения за последователност.
• Добави динамични видове в атрибути API. Динамични видове съхраняване на стойности с интервал от време и заявка могат да бъдат персонализирани с оценители. Всички динамични типове наследяват от DynamicType
• Graph API подобрения за управление на събитието. The GraphEvent има сега точни събития, включително ADD_NODES, REMOVE_NODES, ADD_EDGES, REMOVE_EDGES и VISIBLE_VIEW. Нов GraphEventData интерфейс е създаден, за да изтеглите елементи, свързани със събитията.
• Export API редакции, вдъхновен от ImportAPI. Създай ExporterBuilder интерфейс за създаване на износител и различни износители: GraphExporter, VectorExporter, ByteExporter и CharacterExporter която обхваща обикновените случаи. Начинът, по който износителите пишат данни е осмислен като се използва или java.io.Writer (текст) или java.io.OutputStream (байт). The ExportController е подобрен, за да подкрепи всички случаи на използване, включително файл, писател и износ поток.
• Добави Щуцер подкрепа за ImportAPI и SPI. Подобно DatabaseImporter, интерфейсът на SpigotImporter е нов тип на вносителите. Модификации също да бъдат направени в ImportController да подкрепят канелка внос.
• редакции и подобрения в API Внос и SPI. Целта на редакции е да се реши въпросът с Сингълтън вносители и позволи на потребителите да изпълняват строители интерфейс, който създаде вносители инстанция. Затова интерфейс ImporterBuilder е създаден и трябва да бъдат регистрирани вServiceProvider анотацията. Типовете различни вносители са опростени и оставят по-голям избор на реализации за това как се управлява входа. XML и текстов файл вносителите е сляха в един интерфейс FileImporter, работа с java.io.Reader. Комунални статични методи, например да получат документ от Reader вече могат да бъдат намерени в нова ImportUtils клас. The ImportController е опростено за File внос и вече приема java.io.Reader също. Основното подобрение на тези модули в подкрепата на UI компоненти за вносителите. Целта е да се позволи на вносителите определят за изпълнение ImporterUI да управлявате настройките на тези вносители.
• подобрения в управлението на GraphAPI идентификатори. Системата е сега съхраняване Струнни идентификатори, идващи от потребители. Нови привличат и създателите методи са създадени в графика: Graph.setId (Node, String), Graph.setId (Edge, String), Graph.getNode (String), Graph.getEdge (String). На NodeData.setId () и EdgeData.setId () методите са били отстранени, съвместимост не могат да бъдат съхранявани. Factory е също да се промени, за да се даде възможност за създаване на елементи с String ID директно, тъй като тя вече не е възможно да го направите от NodeData.
• Промени в AttributesAPI с организирането на събития. Системата за справка в AttributeTable е заменен с по-традиционен система за управление на събития, с нови AttributeEvent и AttributeListener интерфейси. Изпълнението на експедицията е и сега на отделна нишка.
• Промени в Вносни модули към отделни основни и потребителски интерфейси. The ImportController сега се прави задачата за внос само и нов ImportControllerUI е показване на потребителския интерфейс (доклад на комитета). Интерфейсът на ImportControllerUI се намира в модула DesktopProject и трябва да бъде потребител правилно да импортирате файл от Plugins. Методите за ImportController може да се използва от комплекта инструменти.

Какво ново във версия 0.7 Alpha 4:

• Освобождаването на алфа4 току-що е била освободена, и ела с набор от нови функции и много bufixes. Следващото издание трябва да е бета и разполагат с по-голяма стабилност и фиксиран набор от функции.

Какво ново във версия 0.7 Alpha 3:

• Повече от 25 бъгове са фиксирани в тази версия , се добавят и някои малки възможности. Версията също допринася за & quot; Gephi третата партия & quot; плъгин източник в центъра Plugins. Catalog в момента се чете от официални и трети източници лица. Две нови модули са били добавени.

Какво ново във версия 0.7 Alpha 2:

• Нови функции:
• подкрепа за по-добро ръба на тегло. Тегло не се променя повече от & quot; Auto мащаб & quot; опция за Import.
• По-добри възли / ръбове броене. Отчитат се само видимите възли.
• Подобряване на статистика / Metrics панели настройки. Добави описание и документация за показатели и техните настройки.
• Project спаси / натоварване е било отстранено. Имайте предвид, че съвместимостта с 0.7alpha1 е счупен.
• Fix механизъм се актуализира автоматично. Допълнителни актуализации ще бъдат достъпни чрез вграден Updater.
• Фиксирани бъгове:
• Application замразяване при импортиране на файлове на Linux (бъг 519,423)
• Window Layout не може да бъде възстановено, когато е скрита (бъг 519,424)
• anner не се вижда на Mac OS X и Linux (бъг 522,403)
• Preview не крие филтрирани елементи (бъг 522,402)
• товар Project / спести интерфейс неуспешен (бъг 522,889)
• празен етикет възел причинява неправилно съобщение за грешка по време на вноса & quot; Непозната възел ID & quot; (Бъг 519,254)
• В GDF износ, премахване на колона не премахва запетаята (бъг 519,810)
• В GDF износ, полето за Id е зле избягал (бъг 519,820)
• Умение ръб филтриране лошо поведение (бъг 522,771)
• Context данни не работи на ненасочена Graph (бъг 522,886)
• Dynamic филтърни дисплеи 0 възел (бъг 523,128)
• Опции за таг работи само за една буква стойности (Bug 519252)
• Бележник, имоти и изход от менюто се появява в прозореца и да не може да се затвори. (Бъг 521,400)
• подобрени изпълнения при регулиране на обхвата с мишката (бъг 521,939)
• Фиксирана бъг, когато се занимават с динамични типове данни други тази дата (бъг 521,544)
• фиксиран бъг с визуалната разпределението на деления (бъг 521 941)
• ползваемост:
• Node и бутон за превключване Edge в VizBar има същата подсказка текст
• Съобщи Panel (Import) е вертикално разтегателен
• Updated Модули:
• DesktopContext
• DesktopBranding
• DesktopHierarchy
• DesktopPartition
• DesktopRanking
• DesktopTools
• VisualizationModule
• DesktopImport
• DesktopLayout
• ProcessorPlugin
• DHNSGraph
• DesktopTimeline
• TimelineAPI
• TimelinePluginUI
• ExportPlugin
• ImportPlugin
• StatisticsPluginUI
• GraphAPI
• ExportPluginUI
• PreviewImpl
• DesktopPreview
• FiltersPlugin
• ImportAPI
• DesktopFilters
• ProjectAPI

Какво ново във версия 0.7 Alpha:

• Gephi 0.7 алфа версия е била освободена и е на разположение за тестване цел. Както 0.7 е пълно пренаписване, той ще трябва алфа и бета версии да замрази функции и да определи всички бъгове.
• Всички останали 0,6 грешки ще бъдат изчистени сега.
• Допълнително бележка за изходния код: Вие трябва да актуализирате Netbeans 6.8 с текущите модули актуализации да бъдат съвместими с настоящата repositiory
.

Какво ново във версия 0.6 Beta 3:

• Bugs свързани с 0.6 серия са били почистени. Бяхме реорганизиране за да стане ясно за 0,7 развитие.
• Факт е, че 0.7 е напълно нова в сравнение с 0.6, така бъгове не са свързани и 0.6 развитие е спряно.
• Затова единственото нещо да направите, е да се изчака 0.7 алфа пришествие.
• Излишно е да казвам бъгове доклади все още съществува и ние много внимаваме да не се повтарят същите грешки за 0.7.

<силни> Изисквания

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment
• OpenGL