Expression2Kinases

Софтуер снимки:
Expression2Kinases
Софтуер детайли:
Версия: 1.5
Дата на качване: 5 May 15
Разрешително: Безплатно
Популярност: 9
Размер: 57129 Kb

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

Генома-широк иРНК профилиране осигурява моментна снимка на състоянието на световната клетки при различни условия. Въпреки това, нивата на иРНК не осигуряват пряка разбиране на добивни регулаторни механизми. Expression2Kinases (X2K) е ​​нов подход за определяне на добивни регулатори вероятно отговорни за наблюдаваните промени в генната експресия целия геном. Чрез интегрирането на чип сл / чип и позиционно-теглото матрици (PWMs) Данните, протеин-протеин взаимодействия, и киназа фосфорилиране на субстрат реакции X2K може да се използва за идентифициране на регулаторни механизми по горното течение на генома-широк разлики в генната експресия. Идеята е първо да се направи извод, най-вероятните транскрипционни фактори, които регулират различията в генната експресия, а след това използвайте протеин-протеинови взаимодействия, за да се свържете идентифицираните транскрипционни фактори, използващи допълнителни протеини за изграждане на транскрипционни регулаторни подмрежи, центърът на тези фактори, и най-накрая да използва киназа-субстрат фосфорилиране реакции протеини, за да идентифицират и ранг кандидатки протеин-кинази, които най-вероятно регулират образуването на идентифицираните транскрипционални комплекси. X2K съдържа и инструменти за извършване на ген-списък обогатяване анализи и предскаже лекарства, които може да отмени или да влошат промени в генната експресия. . Подходът на X2K може предварително нашето разбиране на клетъчната сигнализация и разкрият механизмите на действие на наркотиците

<силни> Изисквания

Java Runtime Environment 6.0

Поддържани операционни системи

Подобен софтуер

Success GCSE IT
Success GCSE IT

23 Sep 15

PhysProf
PhysProf

31 Mar 18

CIECIAP
CIECIAP

23 Sep 15

Друг софтуер на разработчика Mount Sinai School of Medicine Ma'ayan

GATE
GATE

31 Dec 14

Genes2Networks
Genes2Networks

22 Sep 15

PubMedAlertMe
PubMedAlertMe

21 Sep 15

Коментари към Expression2Kinases

Коментари не е намерена
добавите коментар
Включете на изображения!