FlexS прогнозира конформацията и ориентацията на един от лигандите в сравнение с другия. В FlexS Предполага справка-лиганда да бъде твърд, по този начин, тя трябва да бъде дадена в конформация, която е подобна на свързано състояние. Алгоритъмът на суперпозиция в FlexS изискват съвсем малко ръчна намеса. Можете да интегрирате тези знания в изчисленията с FlexS чрез извършване на единични стъпки ръчно. По този начин, FlexS е предназначен за интерактивна работа на лиганд двойки, както и за лиганд-виртуална скрининг. Двете основни приложения на FlexS са лиганд супер позициониране (напр. За CoMFA / QSAR) и виртуален скрининг. Ако имате протеин и задължително да го представлява малка молекула (т.нар референтен-лиганд), но не и структура на протеина, можете да вземете референтната структура като отрицателна пръстови отпечатъци на активното място. FlexS определя сходството между изследвания и референтния структура, като ги приравни. В виртуален скрининг, имате справка-лиганд и набор от съединения и се интересувате от приоритизиране на съединенията за експериментиране.
Коментари не е намерена