QMForge проект може да се използва за анализ на резултатите от квантова химия (DFT) изчисления. Gaussian 98/03, ADF, GAMESS (US), GAMESS (UK), PC-GAMESS, Jaguar и Orca файлове се поддържат (виж по-долу). Следните анализите са налични:
· Mulliken Население Анализ (MPA)
· C-квадрат Население Анализ (ДАЗД)
· Припокриване Население Анализ (OPA)
· Бонд Поръчки Майер
· Charge Анализ на разпадане (CDA)
· Фрагмент Анализ
MPA, CSPA и OPA изисква определена от потребителя набор от фрагменти, и отпечатва процентни вноски тези фрагменти правят един към молекулната орбитала в молекулата. Поръчки Mayer на облигации изчислява поръчките връзката между всяка двойка на атомите в молекулата. CDA и Фрагмент Анализ изискват три или повече изчисления (по един за цялата молекула, и две фрагмент изчисления), и да предостави информация относно взаимодействията на свързване между фрагменти.
QMForge е пряк потомък на PyMOlyze, която е вдъхновена от конзола-базирани, (първоначално) Windows-само програма AOMix, че има функции, включително (и в допълнение към) изброените по-горе. Аз първоначално пише PyMOlyze защото исках един лесен за употреба (т.е.. Графична) Linux програма да се направи MPA за всяка молекулна орбитална на Gaussian изчисления. Аз го удължи за обработка на файлове от геометрия оптимизации, защото аз се озовах който желае мога да превеждам и завъртете оптимизирана структура и да спаси това като XYZ файл. Сега, това е преименуван QMForge, и аз го използвам за почти всичко, с изключение на вземане на молекулярни орбитални снимки и диаграми.
Все още има някои анализи, които QMForge не прави, така че ако тя не се занимава с вашите нужди, разгледайте AOMix (или да стреля ми имейл и ние ще говорим).
QMForge е създаден с помощта на езика Python скриптове, инструментариума QT4 и неговите Python разширения PyQt4, с цифри, а cclib compuational пакет разбор библиотеката. Тя е тествана на Windows XP, Windows 2000 и Mac OS X; тя трябва да работи също толкова добре на всяка дистрибуция на GNU / Linux, въпреки че аз не го изпитват все още.
Какво е новото в тази версия:
· Промяна на името на QMForge
· Подкрепа ORCA
· Превключи на numpy 1.0.2 и 2.1.1 openbabel
· Използва cclib построена от 0,8 клон + неиздавани ORCA анализатор на
Софтуер детайли:
Версия: 2.1
Дата на качване: 3 Jun 15
Разрешително: Безплатно
Популярност: 191
Коментари не е намерена