Topographica

Topographica е софтуерен пакет за изчислителна моделиране на невралната карти.
Целта е да се помогне на учените да разберат функциите на мозъка на нивото на топографските карти, които съставляват сетивни и двигателни системи.
Topographica е предназначена за допълване на много добри ниско ниво неврон симулатори, които са на разположение, като Genesis и Neuron. Тези симулатори са съсредоточени върху моделиране на подробна вътрешна поведението на невроните и малки мрежи от тях.
Topographica вместо фокусира върху структурата на мащабни и функцията, която се вижда само когато много хиляди такива неврони са свързани в топографски карти, съдържащи милиони връзки.
Много важно явления не може да се учи, без такива големи мрежи, включително двумерен организация на визуална ориентация и посока на движение на карти, и обект на сегментирането и групиране процеси.
За да направи такива модели практически, в Topographica основна единица е лист от неврони, отколкото неврон или на част от неврон.
За повечето симулации, листовете могат да бъдат изпълнени на високо равнище, състояща се от абстрактни огневата ставка или да се интегрират-и-пожарни неврони.
Когато се изисква за валидиране или за конкретни явления, Topographica може лесно да бъде разширена с помощта на лист, който осигурява интерфейс за по-подробни модели невронни в други симулатори.
По-детайлни листове могат да се използват временно, напр когато общуват с образеца в реално време.
Навсякъде, Topographica го прави лесен за използване на подходящо ниво на детайлност и сложност, както е определено от достъпната изчислителна мощност, явленията на интереси, както и количеството на биологичните данни за валидиране.
Фигурата горе в дясно показва пример Topographica модел на ранните етапи в зрителната система, моделиране как ретината вход е трансформиран от таламуса, първичната зрителната кора, и по-високи корови области. Защото Topographica е с общо предназначение карта симулатор, тя също така подкрепя всяка друга сензорна модалност, която е организирана в топографски карти, като допир и слух, както и моторни области.
Topographica е свободно достъпна за сваляне и е проект с отворен код, чиито способности може да се разшири и промени от всеки потребител. Ние приветстваме приноса на потребителите, както и да кани заинтересованите хора да се присъединят към нашия глобално разпределени развитие на екипа.
Въпреки, че кодът е все още в много активно развитие, тя е в ежедневна употреба в множество изследователски проекти и академични класове.
Като се има предвид бързото темпо на текущата развитие, като разработчик е може би най-добрият начин да се справи с всички промени.