CWC Simulator

CWC Simulator е C ++ изпълнение на CWC, смятане за представяне и симулация на биологичните системи & Nbsp;. След успешна инсталация (виж INSTALL) вие ще бъдете в състояние да тече симулации над КХО модели, както е показано в някои примери (виж примери /).
<Силен> (команден ред) Interface
Като родово потребител, първо трябва да се показват:

-i model.cwc
-О <> статистика
-t <време>
-s
-п <изтече>
-c <клъстери>
--qt праг <праг>
-q
-W <работници>
Където:
- е името на изпълнимия файл (по подразбиране: scwc);
& Nbsp; - model.cwc е CWC програмата вход (виж примера);
& Nbsp; - статистиката е префикса на изходни файлове;
& Nbsp; - <време> е ограничението за симулация работно време;
& Nbsp; - е периода на извадката (т.е. 0.12, за да получите 250 точки със срок = 30);
& Nbsp; - <изтече> е броят на случаите на симулация;
& Nbsp; - <клъстери> е броят на клъстерите за к-средства
& Nbsp; - е прагът за QT групиране
& Nbsp; - е броят на quantiles;
& Nbsp; - <работници> има обикновено за да съответства на броя на ядрата на вашата система (т.е. 4 за четириядрен процесор).
<Силен> Output
Инструментът произвежда:
- Някои .dat файлове (изследваната изхода на симулациите)
- Някои gnuplot скриптове, за да изготвят статистически анализа използват
Ние работим на цялостно ръководство за употреба

<силни> Характеристики :.

• Gillespie SSA алгоритъм над КХО модели
• Hybrid стохастичен / детерминирани семантика
• Множество симулация с онлайн статистика
• Оптимизация за многоядрени архитектури въз основа на рамково FastFlow
• Extensible статистическа рамка (средно-вариацията, филтрира клъстери и др.)
• повече от една рейтингова семантика (масово действие, Michaelis-Menten, Hill и др.)